In der Großregion gibt es 742 Natura 2000-Gebiete, die eine Fläche von 8.737 km² des Kooperationsgebiets (13%) abdecken.
Natura 2000 beschreibt ein zusammenhängendes Netz europäischer Schutzgebiete, bestehend aus Fauna-Flora-Habitat (FFH)-Gebieten und Vogelschutzgebieten (VSG). Das Netz repräsentiert die typischen, besonderen und seltenen Lebensräume sowie Tier- und Pflanzenarten Europas.
In diesen Gebieten sind geeignete Maßnahmen zu treffen, um den günstigen Erhaltungszustand dieser Lebensraumtypen und Arten nachhaltig zu sichern. Die Auswahl der Gebiete wurde nach für alle Mitgliedstaaten der Europäischen Union einheitlich vorgegebenen Kriterien der Vogelschutzrichtlinie von 1979 und der im Mai 1992 verabschiedeten Fauna-Flora-Habitat (FFH)-Richtlinie vorgenommen.
Der Kommentar auf dem Themenportal des GIS-GR gibt Erläuterungen zu den Zielen und der Zonierung der Gebiete. Die interaktiven Karten auf dem Geoportal ermöglichen es, für jede Gebietskategorie die Abgrenzungen sowie die Datenquelle und den Link zu weiteren Informationen über das jeweilige Gebiet einzusehen.
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